Expulsé du corps universitaire, il concentra sa carrière sur la programmation informatique, travaillant pour la Nasa, Lockheed et Xerox, notamment. Dans les années 1980, il était un ingénieur prospère dans la Silicon Valley, même s’il admit- dans un livre écrit par son biographe par ailleurs « dealer » -qu’il buvait une bouteille de whisky par jour et non seulement sniffait de la cocaïne à son bureau, mais aussi il la vendait à ses collègues. Il expérimenta des drogues hallucinogènes qui l’ont rendu « austère, fou furieux ».

John McAfee s’est fait connaître pour la première fois dans les années 1980 lorsqu’il a fondé sa société de technologie et lancé McAfee VirusScan.

Bien qu’étant un pionnier de la sécurité informatique, il a publiquement admis qu’il n’avait jamais utilisé ni son logiciel ni aucun autre anti-virus sur ses propres ordinateurs.

« Je me protège en changeant constamment mon adresse IP [protocole Internet], en n’attachant mon nom à aucun appareil que j’utilise et en n’allant pas sur des sites où vous pourriez attraper un virus », a-t-il déclaré dans une entrevue diffusée sur une chaine publique anglaise en 2013. « Les sites porno, par exemple, je n’y vais tout simplement pas », a-t-il précisé.

John McFee a également lancé des offres infructueuses pour devenir le candidat d’un Parti libéral aux élections présidentielles de 2016 et 2020.

En 2019, M. McAfee a exprimé son mépris pour les impôts, tweetant qu’il n’avait pas produit de déclarations de revenus depuis huit ans car « la fiscalité est illégale ». La même année, il a été brièvement détenu en République dominicaine pour avoir prétendument introduit des armes dans le pays.